Το Τμήμα Μεσογειακών Σπουδών του Πανεπιστημίου Αιγαίου προσφέρει το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών, με τίτλο «Διακυβέρνηση, Ανάπτυξη και Ασφάλεια στη Μεσόγειο». Το πρόγραμμα παρέχει εξειδικευμένη γνώση για τις πολιτικές, κοινωνικές και γεωπολιτικές εξελίξεις στη Μεσόγειο και διεξάγεται εξ ολοκλήρου εξ αποστάσεως. Δεκτοί γίνονται οι πτυχιούχοι Α.Ε.Ι., Τ.Ε.Ι., Α.Σ.Ε.Ι. και συναφών Σχολών, καθώς και επί πτυχίω φοιτητές με σχετική βεβαίωση. Οι αιτήσεις υποβάλλονται αποκλειστικά ηλεκτρονικά με καταληκτική ημερομηνία υποβολής τις 5 Σεπτεμβρίου.